環境変数「BUNDLE_GEMFILE」で指定する
BUDLE_GEMFILE=Gemfile.local bundle install

「eval_gemfile」で任意のGemfileを実行できる
eval_gemfile "Gemfile"

リポジトリに入れるほどじゃないrubygem使いたいときにignoreなGemfile作っとくと便利